“5.12”四川汶川特大地震导致世界文化遗产——青城山-都江堰受到不同程度破坏，我中心领导及工作人员第一时间赶赴灾区，迅速投身到紧张的灾后重建工作中。5月18日中心主任吴志强教授率先奔赴青城山-都江堰现场，考察灾后受损情况；5月23日，由中心执行主任周俭教授率领的抗震救灾小组与当地遗产地相关部门举行了灾后重建修复研讨会；6月10日起，受四川当地政府委托，中心领导联合同济大学城市与建筑规划学院教授，开始启动青城山-都江堰的灾后重建规划；6月14日，吴志强教授、周俭教授再次到达现场，与上海市政府对口支援都江堰调研团共同协商并确定世界遗产地“青城山-都江堰”抢救修复工程项目工作。
根据灾后受损情况报告，灾后重建规划包括青城山-都江堰景区文物古建筑、仿古建筑及基础设施修复重建，滑坡治理，游客中心、数字化指挥中心和博物馆的建设等。其中文物古建筑修复重建包括二王庙、伏龙观、玉垒关、建福宫、上清宫、天师洞等26处文物古建筑。